EPISODIO 1: VÓRTICE
Clark rescata a Lana del centro de la tormenta en lo que será su primer contacto con su poder para volar, y se da cuenta de que la misma tormenta ha enterrado a su padre en un viejo búnker junto al reportero sin escrúpulos que ha descubierto su secreto. Mientras tanto, Lex se ve abrumado por los cargos sobre su padre, y en medio de la destrucción sembrada durante el tornado, Lionell se ve atrapado bajo los escombros, y Lex duda entre salvarle la vida o dejarle morir; finalmente le salva, pero Lionell queda ciego. Por otro lado, Chloe deja a Clark puesto que se considera menos importante para él que Lana, y no desea vivir un engaño, aunque a él sólo le dice que es mejor ser amigos. Finalmente Clark encuentra a su padre y el reportero, pero la kryptonita que hay en refugio le deja sin fuerzas y el reportero está apunto de asesinar a Jonathan. Pero en ese momento Lex aparece y le dispara, en una oportuna mezcla de ayudar a sus amigos y de conservar en secreto su relación con el reportero.
 EPISODIO 2: CALOR
Clark debe esconderse porque ha descubierto un nuevo poder que está fuera de control y con el que casi hiere accidentalmente a Lana provocando un incendio en su café: su visión calorífica. Con la ayuda de su padre y mucha perseverancia, logra controlarla a voluntad. Por otro lado, una nueva profesora muy hermosa, sufrió un accidente con kryptonita que le dio control para producir feromonas y seducir a cualquier hombre para que actúe a su voluntad, y lo utiliza para convencer a Lex para que se case con ella y hechizar a Jonathan para que lo asesine. Clark debe buscar una manera para evitar que su padre asesine a Lex.
EPISODIO 3: DUPLICIDAD
Pete descubre una nave espacial en el maizal. Obviamente es la de Clark, que desaparece durante el tornado cuando la activan. Clark se enfrenta a sus padres y revela su secreto a Pete, pero es sorprendido por la reacción de su mejor amigo, algo que le hace cuestionar la lealtad de éste. Finalmente Pete comprende sus reservas y entra a formar parte de otra de las atractivas sorpresas de la serie, el hecho de que sepa la verdad sobre Clark, convirtiendose en aliado y compañero.
 EPISODIO 4: EL METEORITO ROJO
La escuela usa, sin saberlo, Kryptonita roja en los anillos de fin de curso y su efecto en Clark sorprende a sus amigos y familiares porque se convierte en un adolescente rebelde y peligroso que decide utilizar sus poderes para hacer el mal, ya que así como la verde afecta a su cuerpo, la roja le trastorna la mente.
 Jonathan y Martha intentan descubrir por qué Clark se comporta de esa manera. Mientras, Lana se siente atraída hacia el nuevo Clark, quien, además, declara su amor por ella, aunque lo estropea todo cuando se lía con una alumna rebelde recién llegada. Finalmente es Pete quien descubre lo de los anillos, y entre él y Jonathan le tienden una emboscada al nuevo y malvado Clark.
EPISODIO 5: NOCTURNO
Clark se preocupa cuando descubre que alguien ha estado dejando cartas de amor para Lana en la tumba de sus padres, donde ella suele ir por las noches a hablar con ellos, y le advierte que tenga cuidado del misterioso poeta. Harta de sentirse sobreprotegida por Clark, Lana sigue al apuesto extraño hasta su casa y descubre que sus padres lo tienen encadenado. Una sorprendente circunstancia que hace que Clark y Pete irrumpan en la casa para intentar salvar al muchacho. Pronto se darán cuenta de los motivos por los que el joven estaba encadenado, ya que es producto de un experimento farmacéutico financiado por la Luthor que lo convierte en un monstruo sin control cuando se expone a la luz del día. Clark deberá llegar a tiempo para evitar que la testaruda Lana, empeñada en buscarle, acabe herida, y reducir al joven, que está decidido a vengarse de Lionell; curiosamente, y pese a los reproches de Jonathan, Martha acepta el puesto de ayudante de Lionell, en un intento de solucionar los problemas económicos de la granja.
 EPISODIO 6: RENACER
La granja está pasando apuros financieros pese a la decisión de Martha, y ella recurre a su padre, del que se había distanciado a causa de las diferencias entre él y Jonathan, y del temor a que no aceptara el secreto de Clark, para pedirle ayuda. Clark está emocionado con la idea de conocer a su abuelo, pero Jonathan no puede asumirlo. Esta negativa obliga a Clark a forzar una reunión que no resulta ser como lo planeado. Mientras, Lana descubre una vieja fotografía de su madre con otro hombre y con la ayuda de Lex descubre que durante un período de separación de sus padres, su madre se quedó embarazada de ella y su padre biológico... podría estar vivo. Por otro lado, una estudiante recién llegada parece tener el poder de rejuvenecer y mantenerse joven gracias a la energía de otros jóvenes y misteriosamente se producen muertes en el instituto Smallville.
EPISODIO 7: GENEALOGÍA
Una misteriosa y perturbada mujer aparece en Smallville diciendo que es la madre biológica de Clark y que su padre es Lionell Luthor. Esto obliga a los Kent a contarle la verdad a Clark. Clark descubre por qué su padre odia a los Luthor, por cómo fue arreglada su adopción y cómo Lionell se aprovechó de la situación para convencer a Jonathan de que respaldara sus acciones financieras en Smallville, y de quién rescató, realmente, a Lex del borde de la muerte, que no fue otro que Jonathan. Lex descubre que la mujer que asegura ser madre de Clark es una de las muchas amantes de su padre, y se plantea el hecho de si no serán Clark y él hermanos. Finalmente se descubre que no es la madre de Clark después de que con ayuda de Pete falseen unas pruebas de ADN, y Lex es secuetrado y casi asesinado por la mujer, pero Clark interviene. Sin embargo, Lex no deja de pensar en que si Clark no era el hijo de esa mujer con su padre... ¿Dónde está éste?
 EPISODIO 8: RYAN
Clark usa sus poderes para salvar a su joven y telepático amigo Ryan de las manos de un malvado doctor que quiere controlar las habilidades del muchacho y lo mantiene encerrado en un centro de investigación. Mientras, Nell, la tía de Lana le dice que van a mudarse a Metrópolis, y ella se niega, y Chloe le ofrece la posibilidad de quedarse en su casa, cosa que acepta. Clark debe encontrar evidencias para conseguir que Ryan quede libre, pero el chico está enfermo de un tumor cerebral que le otorga su poder, y finalmente muere, con lo que Clark queda desolado al perder a lo más parecido a un hermano pequeño que ha tenido jamás.
 EPISODIO 9: DUPLICIDAD
Clark intenta advertir a Lana y a Chloe sobre Ian, un magnífico estudiante nuevo que está saliendo con las dos chicas a la vez. Ellas acusan a Clark de celos y, más tarde, demasiado tarde, se dan cuenta de que Clark tenía razón y de que Ian tiene el poder de duplicarse. Mientras tanto, Lex está muy enfadado con su padre y pierde los estribos cuando destroza el coche de un vigilante de seguridad del parking. Lex decide ir a una clase de control de temperamento donde conoce a una mujer muy interesante, médico del Hospital de Smallville, de la que se enamora. Por su parte Clark tiene que apresurarse para salvara a las dos chicas del ataque del descubierto Ian.
 EPISODIO 10: LOS MUTANTES
Clark y Pete van a hacer motocross. Clark se cae en una cueva y descubre dos tesoros: escrituras indígenas antiguas que esconden en enigma una especie de profecía sobre él y su llegada a la Tierra como futura fuerza del bien, y una hermosa muchacha india que cree que es su alma gemela y despierta los celos de Lana. Desesperado por conservar las escrituras para averiguar algo de su origen, Clark provoca un enfrentamiento entre padre e hijo cuando pide ayuda a Lex para evitar que la constructora de Lionell demuela las cuevas.
Finalmente lo consigue, pero Lex guarda un as en la manga: dejará que su amigo investigue, y él también investigará, sorprendido por el repentino interés de Clark por esas pinturas. Además, la muchacha india, que es mujer lobo, estaba atacando a los constructores, y en un intento de asesinar a Luthor padre, muere en los brazos de Clark.
EPISODIO 11: APARICIONES
Whitney regresa a casa buscando retomar su relación con Lana, que queda aturdida y no sabe como decirle que no para no hacerla más daño del que ya ha debido sufrir; pero su comportamiento, bastante sospechoso y violento, hace que Clark se cuestione sus verdaderos motivos, revelando, finalmente, la verdad: no se trata de Withney sino de la chica obsesionada con Lana y con el poder de adoptar las formas que desea, que ha fingido su muerte para escapar del centro donde estaba recluída. Lex comienza a sospechar de su nueva novia cuando descubre una foto de ella con Lionell, y se crea una desconfianza etre ambos. Finalmente se descubre que Withney ha muerto en combate, y Lana queda destrozada sintiéndose culpable.
EPISODIO 12: LA INSURRECCIÓN
Después de que Lex descubre que Lionell ha instalado cámaras ocultas en la mansión, Lex contrata a unos espías para instalar vigilancia en la oficina de Metrópolis de Lionell. Sin embargo, la situación estaba fuera de control cuando Lionell y Martha sorprenden a los intrusos y son tomados como rehenes. Desesperado por buscar una manera de salvar a su madre sin exponer sus poderes, Clark debe acceder a la oficina por el edificio adyacente, nada menos que el Daily Planet, pero debe llegar en un solo salto. Por si fuera poco, cuando los ladrones consiguen abrir la caja de Lionell, se descubre que sólo hay un montón de lingotes de kryptonita, un expediente confidencial sobre Clark... y la pieza octogonal de la nave.
EPISODIO 13: EL SOSPECHOSO
Después de que Lionell reciba un disparo y esté herido y en coma, Jonathan es arrestado. Pero Clark y Pete realizan su propia investigación sobre el lugar del crimen y descubren que fueron por lo menos dos personas las que intentaron herir a Lionell. Mientras tanto, Lana se vuelve desconfiada cuando su padre, que es abogado, misteriosamente, rechaza la petición para defender a Jonathan, y se descubre que fue hundido por la Luthor años atrás. Finalmente Clark consigue encajar las piezas y el agresor de Lionell no es otro que el sheriff, que ha hecho complot para eliminarlo a costa de culpar a Jonathan, uno de sus mejores amigos. Lionell, evidentemente, se recupera.
EPISODIO 14: EUFORIA
Un parásito que vive en las cuevas de las pinturas rupestres sobre la profecía de Clark, infecta a Pete y a Chloe y les hacer ser atrevidos y amantes de lo arriesgado. Pete utiliza las rocas del meteorito rojo para convencer a Clark de ir todos juntos en busca de una aventura peligrosa. Clark, no sólo hace alarde de sus poderes, sino que también se enfrenta y amenaza a Lex, y besa a Chloe en presencia de una Lana que no da crédito a lo que está viendo, justo cuando parecía que al fin iban a salir juntos. Al final, Clark logrará desprenderse de la piedra roja y tendrá que salvar la vida a sus amigos.
EPISODIO 15: EL HIJO PRÓDIGO
Lex finalmente localiza a Lucas, su hermano perdido, y lo lleva a casa con la esperanza de que puedan reconciliarse y unirse de nuevo en alianza contra su padre. Pero las intrigas de Lionell ponen en peligro a los tres, Lex es echado de casa y todo lo que ten le es arrebatado por su padre y se pregunta de quiénes puede fiarse. No le queda más refugio que vivir una temporada con los Kent, reconciliándose así con Jonathan, que cambia su visión del joven. Mientras, Clark decide aceptar un trabajo en el Talon. Finalmente Lex recupera su fortuna y su empresa en un ainteligente trampa que le tienden a Lionell entre él y su hermano, en la que descubre, además, que lleva tiempo fingiendo ser ciego tras haber recuperado la vista de nuevo.
EPISODIO 16: FIEBRE
Martha enferma por inhalar accidentalmente polvo de kryptonita mientras enterraba en el sótano la llave de la nave de Clark, asustada por perderle si el joven abría la nave y descubría sus secretos. Clark se infecta también y Jonathan debe colarse en una base militar donde han guardado la pieza de la nave para activarla y exponer a Martha y Clark a su poder curativo, tras enterarse de la sorprendente noticia de que durante el tornado, al parecer la radiación de la nave curó a Martha de su esterilidad, puesto que ahora está embarazada.
EPISODIO 17: LA PIEDRA DE ROSETTA
Clark no soporta la incertiumbre de unos extraños sueños que están acosándole y decide utilizar la llave octogonal de la nave en el agujero idéntico de las cuevas, y en ese momento recibe una descarga de energía que le dota de conocimientos sobre su idioma natal, el kryptoniano. Además, recibe un aluvión de mails de un tal doctor Virgil Swann, interpretado por Christopher Reeve, que ha descifrado un mensaje que llegó con la lluvia de meteoritos y que revela a Clark parte de los misterios sobre su origen: su nombre es Kal-El, de Krypton. Pero Krypton ya no existe. Aunque lo que descubrirá Clark cuando abra la nave no le gustará...
A mi juicio, y por ahora, el mejor capítulo de la serie, espectaculares revelaciones y sobre todo el volver a ver a Reeve en Superman aunque sea de este modo. Cabe destacar que durnte toda la conversación de Clark con Swann, suenan los acordes de la músca original de Superman de John Williams y el tema de Krypton. Espectacular y muy emotivo. Por cierto, si quieres leer una entrevista hecha a Tom Welling en la que habla de este capítulo y de su admiración por Reeve  EPISODIO 18: EL VISITANTE
Clark comienza a creer que Cyrus, un extraño recién llegado a su instituto y que dice ser un extraterrestre, puede ser de su mismo planeta. El chico parece tener el poder de sanar con sus manos, lo que desconcierta a Clark, pero otros muchos indicios le dan que pensar que puede ser posible que él no fuera el último superviviente.
EPISODIO 19: PRECIPICIO
Unos estudiantes atacan a Lana en el café y Clark les da una paliza, siendo demandado por una enorme suma que puede hacer que sus padres pierdan la granja. Por otro lado, un viejo novio de la doctora Helen, la novia de Luthor, vuelve para reconquistarla y resulta ser un peligroso perturbado que está a punto de hacer que todo acabe en tragedia. Clark se verá entre la espada y la pared por ayudar a su amigo Lex y sus propios problemas con la ley.
EPISODIO 20: EL TESTIGO
Por casualidad, Clark es testigo de un robo a una furgoneta de los Luthor. Resultan ser unos jóvenes que inhalan kryptonita fundida adquiriendo la misma fuerza que Clark. Para evitar que Clark acuda a la policía, los ladrones atacan a Jonathan y a Martha y Clark les pide que se marchen a Metropolis hasta que logre controlar la situación. Además, la relación entre el joven futuro superhéroe y Chloe va de mal en peor, y ésta se está planteando al final del episodio el aceptar una sustanciosa oferta de Luthor padre para investigar "la verdad" con el propósito de... hacer historia.
EPISODIO 21: CLONACIÓN
Lana cree estar viendo nada menos que el fantasma de su mejor amiga de niña, que murió en un accidente al ahogarse al caer por un puente sin que ella pudiese hacer nada por salvarla. Clark investigará y descubrirá que en realidad se trata, por lo visto, de un clon que ha hecho el padre de la niña financiado, cómo no, por la Luthor de Lionell. Por cierto que al final del capítulo podemos ver como al fin Clark y Lana tienen el valor de declararse el uno al otro.
EPISODIO 22: LA LLAMADA
Clark es padrino de la boda de Lex y Helen y le toca hacer el discurso de la cena de ensayo. Lana, por su parte, se muestra confundida por lo ocurrido entre Clark y ella la noche anterior, porque no quiere estropear su amistad. Además, el doctor Walden, el lingüista que entra en estado catatónico tras recibir la sobrecarga de información kryptoniana de la cueva, despierta obsesionado por matar a Clark para impedir que gobierne el mundo. Chloe recibe su primer encargo de Lionell, investigar a Clark a fondo, y se niega. Al final del capítulo Clark y Lana olvidan sus temores y siguen adelante con lo suyo, pero Chloe les ve. Y Clark escucha una misteriosa voz que lo llama desde su nave en el sótano: "Kal-El, es la hora..."
EPISODIO 23: EL ÉXODO
La nave es la memoria de Jor-El, el padre de Clark, y le advierte que al mediodía deberá obedecer todas sus órdenes y apartarse de todos los humanos que le importan. Clark no está dispuesto a aceptar su destino impuesto y urde un plan para destruir la nave, creyendo ese el único modo de evitarlo: Lionell ha conseguido crear una réplica en kryptonita de la llave de la nave, para introducirla en la cueva y averigüar el secreto, y Clark con ayuda de Pete la roba, y destruye la nave con ella. La onda expansiva de la nave hace que los Kent sufran un accidente cuando vuelven a casa en la camioneta para impedir que Clark haga alguna locura, y Martha pierde al niño. Jonathan no puede ni mirar a Clark a la cara, y Clark toma la dura decisión de marcharse lejos de todos, sintiéndose hundido y culpable. Se pone un anillo de kryptonita roja para poder actuar al contrario de cómo suele hacerlo, y abandona Smallville, a sus padres y a Lana. Por su parte, Chloe, herida de amor por Clark y Lana, sabiendo que están juntos, decide aceptar la oferta de Luthor. Y Lex, recién casado, que ha subido al avión para irse con Helen a su luna de miel, despierta sólo, sin nadie, con los controles destrozados y se estrella contra el océano, en lo que todo apunta a la traición de Helen con Lionell. El dramático capítulo y la temporada terminan con una imagen de Clark en la moto, en dirección a quién sabe qué lugar, y la voz en off de Jor-El (que es Terence Stamp, el general Zod en Superman II) diciendo: "Me obedecerás, Kal-El"
FIN DE LA SEGUNDA TEMPORADA
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